Молекулярно-эпидемиологическое расследование вспышки серозных менингитов в Новосибирской области

Abstract

Целью настоящей работы явилось расследование вспышки серозных менингитов в Новосибирской области в 2008–2009 гг., а также изучение генетического разнообразия и молекулярно-эпидемиологиче- ской характеристики энтеровирусов человека, вызвавших случаи серозного менингита. Материал и методы. В настоящей работе исследованы образцы спинномозговой жидкости от 199 пациентов с диагнозом «серозный менингит», основанным на клинической картине заболевания (головная боль, ригидность затылочных мышц, температура, тошнота, рвота) и подтвержденным лабораторными исследованиями спинномозговой жидкости (лимфоцитарный цитоз более10 кл/мкл). Все образцы исследованы методом ПЦР на наличие РНК Enterovirus и Flavivirus, ДНК Myc. tuberculosis, Borrelia spp., Neisseria spp. В результате исследования проб отмечено отсутствие РНК Flavivirus, ДНК Myc. tuberculosis, Borrelia spp., Neisseria spp., однако в 73 образцах (в 37% случаев) была выявлена РНК энтеровирусов (ЭВ). Определение нуклеотидных последовательностей ЭВ по регионам 5’UTR и VP1 выявило их принадлежность к следующим генотипам: наибольшая доля была представлена генотипом ECHO 30 (62 %); также встречались Cox A2 (8%), Cox A4 (5%), Cox A14 (3%), Cox A16 (5%), Cox B5 (8%), ECHO 6 (3%), ECHO 9 (3%) и ECHO 25 (3%). В 2008 г. большая часть выявленных у населения Новосибирской области изолятов ЭВ, вызывавших симптомы менингита, принадлежала к генотипу ECHO 30 (76%). В 2009 г. клинических образцов, содержавших изоляты генотипа ECHO 30, обнаружено не было, однако наибольшая доля выявленных энтеровирусов относился к генотипу Cox A2 (33%) и Cox A4 (22%). Таким образом, в 2008 г. нами зафиксирована вспышка серозных менингитов, основным этиологическим фактором которых являлся энтеровирус ECHO 30, а подъем заболеваемости в 2009 г. связан с циркуляцией среди населения новых генотипов энтеровирусов. Исследованные штаммы были депонированы в международной базе GenBank под номерами KP258231-KP258235, HM559584.

The aim of this study was to investigate the outbreak of aseptic meningitis in the Novosibirsk region in 2008–2009. We studied genetic diversity and molecular-epidemiological characteristics of human enteroviruses that caused aseptic meningitis. Materials and metods. In the present study we investigated samples of cerebrospinal fluid from 199 patients with a diagnosis “aseptic meningitis”, based on the clinical characteristics of the disease (headache, stiff neck, fever, nausea, vomiting), and confirmed by laboratory tests of spinal fluid (lymphocyte cell count more 10 cells/ml). All samples were tested by PCR for RNA of Enterovirus and Flavivirus and DNA Myc. tuberculosis, Borrelia spp., Neisseria spp. In the samples there were not found RNA Flavivirus, DNA Myc. tuberculosis, Borrelia spp., Neisseria spp., but in 73 samples (37%) was identified RNA enterovirus (EV). Determination of nucleotide sequences of 5’UTR and VP1-region of EV revealed that they belong to the following genotypes: the highest percentage was presented by genotype ECHO 30 (62%); another genotypes were Cox A2 (8%), Cox A4 (5%), Cox A14 (3%), Cox A16 (5%), Cox B5 (8%), ECHO 6 (3%), ECHO 9 (3% ) and ECHO 25 (3%). In 2008 most of the EV that caused the symptoms of aseptic meningitis belonged to genotype ECHO 30 (76%). In 2009 the clinical specimens containing genotype ECHO 30 were not found, but the largest percentage of EV belonged to genotypes Cox A2 (33%) and Cox A4 (22%). Thus, in 2008 we recorded outbreak of aseptic meningitis, the major etiological factor was enterovirus ECHO 30. And the rise of the incidence of aseptic meningitis in 2009 is related to the circulation of new genotypes of EV. The investigated strains were deposited in an international database GenBank under accession numbers KP258231-KP258235, HM559584.