Ассоциация вариантов нуклеотидной последовательности гена GSS с риском развития острого билиарного панкреатита

Abstract

Цель: исследовать вклад вариантов нуклеотидной последовательности rs13041792, rs1801310 и rs6088660 гена GSS и некоторых средовых факторов в развитие острого билиарного панкреатита (ОБП) и его осложнений. Материалы и методы. От 84 пациентов с ОБП и 573 здоровых индивидов были получены образцы крови для выделения геномной ДНК. Обе группы были сопоставимы по полу и возрасту. Диагностику заболевания проводили с использованием клинических рекомендаций, разработанных рабочей группой Российского общества хирургов. Геномную ДНК выделяли стандартным методом фенольно-хлороформной экстракции. Мультиплексное генотипирование SNPs проводили по технологии iPLEX на генетическом анализаторе MALDI-TOF MassARRAY-4. Статистическую обработку данных осуществляли с использованием программы Statistica 10, SNPStats. Результаты. Установлено, что недостаточное употребление свежих овощей и фруктов повышает риск развития ОБП у носителей генотипов G/A-A/A rs1801310 GSS (р = 0,02). Проведенный анализ установил ассоциацию аллеля Т rs6088660 с вероятностью развития гнойного парапанкреатита (р = 0,007) и дигестивных свищей (р = 0,02). Высокая вероятность смертельного исхода была связана с носительством SNPs rs1801310 (генотип G/A, р = 0,002) и rs6088660 (генотип C/T, р = 0,01) гена GSS. Заключение. Варианты нуклеотидной последовательности rs6088660 и rs1801310 гена GSS можно использовать для прогнозирования течения ОБП.Aim. To investigate the role of single nucleotide polymorphisms (SNPs) rs13041792, rs1801310, and rs6088660 in the GSS gene and environmental factors in the development of acute biliary pancreatitis (ABP) and its complications. Materials and methods. The material for the study was blood samples obtained from 84 patients with ABP and 573 healthy individuals. Both groups were comparable in terms of gender and age. To diagnose ABP, we used the clinical guidelines recommended by the working group of the Russian Society of Surgeons. DNA was isolated by phenol / chloroform extraction. Multiplex genotyping of SNPs was performed by the iPLEX assay on the MALDITOF MassARRAY-4 genetic analyzer. Statistical data processing was performed using Statistica 10 and SNPStats software. Results. We found that insufficient consumption of fresh vegetables and fruits increased the probability of ABP in carriers of genotypes G/A-A/A at rs1801310 in GSS (p = 0.02). The analysis revealed the association of the T allele at rs6088660 with the odds for developing acute pancreatitis (p = 0.007) and digestive fistulas (p = 0.02). A high probability of death was associated with rs1801310 (G/A genotype, p = 0.002) and rs6088660 (C/T genotype, p = 0.01) in the GSS gene. Conclusion. SNPs rs6088660 and rs1801310 in the GSS gene can be used to predict the course of ABP.