Валидация результатов широкогеномного исследования связи полиморфных локусов с повышенной частотой маркеров радиационного воздействия

Abstract

Представлены результаты исследования по выборочной валидации, на большой независимой выборке связи генетических полиморфизмов с повышенной частотой хромосомных аберраций. Эти полиморфизмы ранее были индентифицированы в ходе собственных широкогеномных микрочиповых исследований, они показали связь повышенной частотой дицентриков и кольцевых хромосом, индуцируемых радиационным воздействием. Исследование проводилось на выборке работников Сибирского химического комбината (г. Северск) (n = 573), подвергавшихся радиационному воздействию в дозе от 40 до 400 мЗв. Связь с повышенной частотой дицентриков и (или) кольцевых хромосом была подтверждена для пяти полиморфных локусов из шести обследованных: INSR rs1051690 – гена инсулинового рецептора, PCTP rs2114443 – гена белка-переносчика фосфатидилхолина, VCAM1 rs1041163 – гена сиалогликопротеина мембраны эндотелиальных клеток, TNKS rs7462102 – гена танкиразы, WRN rs1800389 – гена синдрома Вернера. Полиморфизм гена инсулиноподобного фактора роста 1 (IGF1 rs2373721) не подтвердил связь с повышенной частотой маркеров радиационного воздействия.

The results from the selective validation research into the association between genetic polymorphisms and the frequency of cytogenetic abnormalities on a large independent sample are analyzed. These polymorphisms have been identified previously during own microarray studies. It has been shown an association with the frequency of dicentric and ring chromosomes induced by radiation exposure. The study was conducted among Siberian Group of Chemical Enterprises healthy employees (n = 573) exposed to professional irradiation in a dose range of 40–400 mSv. We have found that 5 SNP are confirmed to be associated with the frequency of dicentric and ring: INSR rs1051690 – insulin receptor gene; WRNrs2725349 – Werner syndrome gene, RecQ helicase-like; VCAM1 rs1041163 – vascular cell adhesion molecule 1 gene; PCTP rs2114443 – phosphatidylcholine transfer protein gene; TNKS rs7462102 – tankyrase gene; TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase. IGF1 rs2373721 – insulin-like growth factor 1 gene has not confirmed to be associated with the frequency of dicentric and ring chromosomes.