Поиск генов подверженности туберкулезу с использованием результатов полногеномного исследования болезни Крона

Abstract

Болезнь Крона (БК) и туберкулез (ТБ) имеют сходные патогенетические механизмы, что предполагает также общность генетической компоненты подверженности этим болезням. Для обоснования этого предположения у русских Томской области и коренного населения Республики Тувы проведен анализ ассоциации ТБ с полиморфными вариантами генов, связанных по данным полногеномных исследований с БК. У русских впервые обнаружены статистически значимые ассоциации ТБ с полиморфизмами rs2872507 ( ORMDL3 ), rs3810936 ( TNFSF15 ), rs10192702 ( ATG16 L1 ), rs9286879 (1q24.3), rs10507523 (13q14.11). У тувинцев связь с заболеванием выявлена для полиморфных вариантов rs1407308 ( TNFSF15 )и rs1736135 (21q21.1). Обнаруженные ассоциации генных маркеров с заболеванием могут быть обусловлены функциональной ролью кодируемых белков и их патогенетическим влиянием на иммунные реакции, связанные с развитием инфекции. Таким образом, изучение полиморфизма генов, влияющих на развитие БК, позволило обнаружить новые гены-кандидаты подверженности ТБ.

Crohn’s disease (CD) and tuberculosis (TB) share several mechanisms of pathogenesis, and this suggests they also have common genetic susceptibility factors. To test this hypothesis, we performed the analysis of association between TB and polymorphisms of genes associated with CD, according to the results of genome-wide association studies, in Russians from Tomsk and indigenous people from Tuva. For the first time, The rs2872507 (ORMDL3), rs3810936 (TNFSF15), rs10192702 (ATG16L1), rs9286879 (1q24.3), rs10507523 (13q14.11) polymorphisms were found to be associated with TB in Russians. The rs1407308 (TNFSF15) and rs1736135 (21q21.1) were associated with the disease in Tuvinians. The associations found are likely due to the functional role of the relevant proteins and their pathogenetic influence on the immune reaction underlying tuberculosis infection. Overall, the study of polymorphisms associated with CD allowed us to identify new candidate genes for TB.